文献分享---乳腺癌复发肺转移的空间多组学分析

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分类：#单细胞空间交响乐 #Week172025

方法汇总---Xenium、CosMx大panel细胞通讯的分析思路

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方法分享---利用TACIT解卷积空间多组学中细胞类型和状态

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脚本更新----cellular neighborhood

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分类：#单细胞空间交响乐 #Week162025

方法更新----关于HD、Stereo-seq在bin模式下的细胞邻域分析（double）

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文献分享---抗体-药物偶联物SHR-A1811在HER 2阳性乳腺癌新辅助治疗中疗效的空间决定因素（WGS + Xenium）

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文献分享---抗体-药物偶联物SHR-A1811在HER 2阳性乳腺癌新辅助治疗中疗效的空间决定因素（WGS + Xenium）

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分类：#单细胞空间交响乐 #Week152025

文献分享---单细胞和空间RNA测序识别早发性与晚发性前列腺癌的不同微环境和进展特征

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文献分享---乳腺癌的空间分辨图谱揭示了微静脉niche控制淋巴细胞外渗的细胞间机制（Stereo-seq）

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方法汇总---细胞临近推断方法比较与优化

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内容复习----visium分析hotspot与空间密度图

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方法分享---利用多组学和生态空间分析对组织状态进行定量表征（CODEX、CosMx）

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内容复习----10X visium多样本的共定位分析

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内容复习---借助Seurat的力量分析细胞niche（Xenium、CosMx、CODEX）

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分类：#单细胞空间交响乐 #Week142025

文献分享---成人前列腺的空间分辨转录组学分析（scRNA + scATAC + Visium）

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文献分享---单细胞分辨率下心脏纤维化的动态分子图谱显示心脏成纤维细胞中的CD248与免疫细胞相互作用（Stereo-seq）

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空间文献分享---NF2相关神经鞘瘤病前庭神经鞘瘤中免疫细胞环境的空间定位

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脚本更新---依据目标细胞邻域细胞组成区别细胞亚型（Xenium、CosMx、CODEX、MERSCOPE）

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文献分享---通过单细胞空间多组学揭示的癌症相关成纤维细胞的保守空间亚型和细胞邻域

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内容复习---高精度空间数据分析（CODEX、CosMx、IMC）

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