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脚本更新---依据目标细胞邻域细胞组成区别细胞亚型（Xenium、CosMx、CODEX、MERSCOPE）

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分类：#单细胞空间交响乐 #Week142025
单细胞空间交响乐 Week142025
文献分享---通过单细胞空间多组学揭示的癌症相关成纤维细胞的保守空间亚型和细胞邻域

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内容复习---高精度空间数据分析（CODEX、CosMx、IMC）

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综述分享---肿瘤微环境的时空特征（niche）

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脚本更新---空间转录组细胞类型距离度量与通讯

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方法梳理---SMI空间平台数据分析

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文献分享---原发性和转移性脑肿瘤的内皮细胞和血管壁细胞的单细胞图谱

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顶刊分享--小鼠和人肺中抗纤维化因子的组织学特征

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脚本更新--空间转录组邻域分析 + kmeans/leiden聚类

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顶刊分享--协调的细胞邻域在结直肠癌侵袭前沿增强抗肿瘤免疫（CODEX）

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脚本更新---高精度平台的Recurrent cellular neighborhoods (RCNs) 分析

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脚本更新--利用visium数据分析信号流（COMMOT）的主要细胞类型参与者

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顶刊分享----空间免疫评分系统预测肝癌复发

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脚本更新----空间细胞网络图的绘制

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多组学更新---WES联合scRNA分析肿瘤CNV事件

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脚本更新--10X HD数据tiff图片进行细胞核分割（Stardist）与数据对齐

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脚本更新--10X HD数据tiff图片进行细胞核分割（Stardist）与数据对齐
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文献分享--中国人群胰腺癌患者的致病性胚系变异

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文献分享--中国人群胰腺癌患者的致病性胚系变异
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内容汇总--空间转录组的生态位（niche）分析

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内容汇总--空间转录组的生态位（niche）分析
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文献分享（第四篇HD文章）---小胶质细胞机制驱动阿尔茨海默病免疫治疗患者的amyloid-β清除

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文献分享（第四篇HD文章）---小胶质细胞机制驱动阿尔茨海默病免疫治疗患者的amyloid-β清除
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10X HD数据分析进行COMMOT信号流分析

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