聚合微信公众号订阅的文章，左手湿，右手干！
用于癌症免疫治疗的炎性小体激活纳米疫苗
评论：最近出现了一系列先进的纳米疫苗 （NV） 联合免疫疗法用于治疗恶性肿瘤，并显示出良好的肿瘤抑制作用。然而，它们的有效性通常受到肿瘤微环境中免疫抑制的限制。为了克服这一挑战，需要新的 NV 开发方法来改善抗原交叉呈递并重塑肿瘤微环境。在本期《癌症研究》中，周及其同事开发了一种光增强的炎性小体激活纳米疫苗（PIN），旨在精确、原位递送肿瘤抗原和激活NLRP3炎性小体通路的疏水小分子。近红外光暴露通过在 BODIPY 修饰的 PAMAM 纳米载体中诱导光触发电荷反转，使 PIN 在肿瘤部位积累。PINs 的全身给药导致 NLRP3 炎性小体的有效瘤内激活和光照后抗原呈递细胞中的抗原交叉呈递，通过增加促炎细胞因子的产生而增强免疫反应，而没有明显的全身毒性。重要的是，PINs 还增强了免疫检查点阻断的功效，并促进了黑色素瘤和肝细胞癌小鼠模型中长期免疫记忆的发育。总体而言，炎性小体激活 NV 代表了一 |
原文链接：xmolJournal
分类：#xmolJournal #Week462024
评论：最近出现了一系列先进的纳米疫苗 （NV） 联合免疫疗法用于治疗恶性肿瘤，并显示出良好的肿瘤抑制作用。然而，它们的有效性通常受到肿瘤微环境中免疫抑制的限制。为了克服这一挑战，需要新的 NV 开发方法来改善抗原交叉呈递并重塑肿瘤微环境。在本期《癌症研究》中，周及其同事开发了一种光增强的炎性小体激活纳米疫苗（PIN），旨在精确、原位递送肿瘤抗原和激活NLRP3炎性小体通路的疏水小分子。近红外光暴露通过在 BODIPY 修饰的 PAMAM 纳米载体中诱导光触发电荷反转，使 PIN 在肿瘤部位积累。PINs 的全身给药导致 NLRP3 炎性小体的有效瘤内激活和光照后抗原呈递细胞中的抗原交叉呈递，通过增加促炎细胞因子的产生而增强免疫反应，而没有明显的全身毒性。重要的是，PINs 还增强了免疫检查点阻断的功效，并促进了黑色素瘤和肝细胞癌小鼠模型中长期免疫记忆的发育。总体而言，炎性小体激活 NV 代表了一 |
原文链接：xmolJournal
分类：#xmolJournal #Week462024
肿瘤相关巨噬细胞中的清道夫受体 CD36 通过抑制 I 型干扰素信号传导促进癌症进展
评论：肿瘤相关巨噬细胞 （TAM） 是异质性髓系细胞群，决定肿瘤微环境 （TME） 的炎症基调。在这项研究中，我们揭示了清道夫受体 CD36 抑制 TAM 炎症状态的机制。CD36 在 TAMs 中上调并与免疫抑制特征相关，CD36 的髓系特异性缺失显着减少了肿瘤生长。此外，CD36 缺陷的 TAM 获得了炎症特征，包括 I 型干扰素 （IFN-I） 产生增加，反映了在癌症患者中观察到的 CD36 和 IFN-I 反应之间的负相关。CD36 缺陷型 TAM 产生的 IFN-I，尤其是 IFNβ，直接诱导肿瘤细胞静止并延迟肿瘤生长。从机制上讲，CD36 通过氧化脂质信号转导下游的 p38 激活，在巨噬细胞中充当 IFN-I 信号转导的天然抑制因子。这些发现确立了 CD36 是 TAM 功能和肿瘤炎症微环境的关键调节因子，为药理学抑制 CD36 以恢复抗肿瘤免疫提供了额外的理由。 |
原文链接：xmolJournal
分类：#xmolJournal #Week462024
评论：肿瘤相关巨噬细胞 （TAM） 是异质性髓系细胞群，决定肿瘤微环境 （TME） 的炎症基调。在这项研究中，我们揭示了清道夫受体 CD36 抑制 TAM 炎症状态的机制。CD36 在 TAMs 中上调并与免疫抑制特征相关，CD36 的髓系特异性缺失显着减少了肿瘤生长。此外，CD36 缺陷的 TAM 获得了炎症特征，包括 I 型干扰素 （IFN-I） 产生增加，反映了在癌症患者中观察到的 CD36 和 IFN-I 反应之间的负相关。CD36 缺陷型 TAM 产生的 IFN-I，尤其是 IFNβ，直接诱导肿瘤细胞静止并延迟肿瘤生长。从机制上讲，CD36 通过氧化脂质信号转导下游的 p38 激活，在巨噬细胞中充当 IFN-I 信号转导的天然抑制因子。这些发现确立了 CD36 是 TAM 功能和肿瘤炎症微环境的关键调节因子，为药理学抑制 CD36 以恢复抗肿瘤免疫提供了额外的理由。 |
原文链接：xmolJournal
分类：#xmolJournal #Week462024
癌症中的染色体分裂
评论：染色体分裂是一种突变现象，其中单个灾难性事件导致一条或几条染色体的广泛重排。这种极端形式的基因组不稳定性已在 30-50% 的癌症中检测到。过去几年进行的研究揭示了染色体分裂如何产生的见解，并破译了染色体断裂的一些细胞和分子后果。本综述讨论了染色体脱毛的定义特征，并描述了其在不同癌症类型中的患病率，如在人类癌症样本中检测到的染色体脱毛的表现所示。详细讨论了染色体分裂的不同机制模型，这些模型源自通过实验操作实现因果推理的体外系统。还强调了染色体分裂对癌症发展的贡献、癌细胞可能从染色体分裂中获得的选择性优势、染色体分裂肿瘤的进化轨迹以及染色分裂细胞带来的潜在脆弱性和治疗机会。 |
原文链接：xmolJournal
分类：#xmolJournal #Week462024
评论：染色体分裂是一种突变现象，其中单个灾难性事件导致一条或几条染色体的广泛重排。这种极端形式的基因组不稳定性已在 30-50% 的癌症中检测到。过去几年进行的研究揭示了染色体分裂如何产生的见解，并破译了染色体断裂的一些细胞和分子后果。本综述讨论了染色体脱毛的定义特征，并描述了其在不同癌症类型中的患病率，如在人类癌症样本中检测到的染色体脱毛的表现所示。详细讨论了染色体分裂的不同机制模型，这些模型源自通过实验操作实现因果推理的体外系统。还强调了染色体分裂对癌症发展的贡献、癌细胞可能从染色体分裂中获得的选择性优势、染色体分裂肿瘤的进化轨迹以及染色分裂细胞带来的潜在脆弱性和治疗机会。 |
原文链接：xmolJournal
分类：#xmolJournal #Week462024
雷莫芦单抗联合紫杉醇作为晚期 HER2 阴性胃癌或胃食管结合部癌 （ARMANI） 患者一线奥沙利铂化疗的转换维持与继续治疗：一项随机、开放标签、多中心、3 期试验
评论： 背景 紫杉醇加雷莫芦单抗被推荐作为晚期 HER2 阴性胃癌或胃食管结合部癌患者的二线治疗方案。我们旨在评估与继续奥沙利铂和氟嘧啶双药化疗作为一线策略相比，紫杉醇加雷莫芦单抗的转换维持或早期二线治疗是否改善了结局。 方法 ARMANI 是一项多中心、开放标签、随机、3 期试验，在意大利的 31 家医院进行。我们招募了 18 岁或以上、东部肿瘤合作组体能状态为 0 或 1 且局部晚期不可切除或转移性 HER2 阴性胃癌或胃食管交界处癌的患者，这些患者在 FOLFOX （亚叶酸、氟尿嘧啶和奥沙利铂） 或 CAPOX （卡培他滨和奥沙利铂） 治疗 3 个月后疾病得到控制。患者被随机分配 （1：1） 第 1 天、第 8 天和第 15 天紫杉醇 80 mg/m2 加第 1 天和第 15 天 8 mg/kg 雷莫芦单抗静脉注射 （转换维持组） 或继续以奥沙利铂为基础的双药化疗 （FOLFOX 或 CAPOX） |
原文链接：xmolJournal
分类：#xmolJournal #Week462024
评论： 背景 紫杉醇加雷莫芦单抗被推荐作为晚期 HER2 阴性胃癌或胃食管结合部癌患者的二线治疗方案。我们旨在评估与继续奥沙利铂和氟嘧啶双药化疗作为一线策略相比，紫杉醇加雷莫芦单抗的转换维持或早期二线治疗是否改善了结局。 方法 ARMANI 是一项多中心、开放标签、随机、3 期试验，在意大利的 31 家医院进行。我们招募了 18 岁或以上、东部肿瘤合作组体能状态为 0 或 1 且局部晚期不可切除或转移性 HER2 阴性胃癌或胃食管交界处癌的患者，这些患者在 FOLFOX （亚叶酸、氟尿嘧啶和奥沙利铂） 或 CAPOX （卡培他滨和奥沙利铂） 治疗 3 个月后疾病得到控制。患者被随机分配 （1：1） 第 1 天、第 8 天和第 15 天紫杉醇 80 mg/m2 加第 1 天和第 15 天 8 mg/kg 雷莫芦单抗静脉注射 （转换维持组） 或继续以奥沙利铂为基础的双药化疗 （FOLFOX 或 CAPOX） |
原文链接：xmolJournal
分类：#xmolJournal #Week462024
青少年和年轻人当前和未来的全球癌症负担：一项基于人群的研究
评论： 背景 与儿童和老年人相比，青少年和年轻人（15-39 岁）的癌症负担研究不足。我们旨在量化 2022 年和 2050 年全球青少年和年轻成人癌症的负担，并探索发病率、死亡率和病死率的模式。 方法 在这项基于人群的研究中，我们使用 GLOBOCAN 数据库量化了青少年和年轻人的新病例和癌症相关死亡人数，以及相应的年龄标准化发病率和死亡率 （ASR;每 100 000 名 15-39 岁的人）。对所有癌症组合的估计值进行量化，不包括非黑色素瘤皮肤癌和 33 种特定癌症类型。使用死亡率与发病率比估计病死率。在世界、区域、人类发展指数 （HDI） 和收入水平上计算总体和性别特异性估计。我们使用联合国 2019 年世界人口展望修订版，将 GLOBOCAN 2022 比率应用于 2050 年的性别特定人口预测，从而估计了未来的癌症负担。 发现 2022 年，青少年和年轻人估计有 1 300 196 |
原文链接：xmolJournal
分类：#xmolJournal #Week462024
评论： 背景 与儿童和老年人相比，青少年和年轻人（15-39 岁）的癌症负担研究不足。我们旨在量化 2022 年和 2050 年全球青少年和年轻成人癌症的负担，并探索发病率、死亡率和病死率的模式。 方法 在这项基于人群的研究中，我们使用 GLOBOCAN 数据库量化了青少年和年轻人的新病例和癌症相关死亡人数，以及相应的年龄标准化发病率和死亡率 （ASR;每 100 000 名 15-39 岁的人）。对所有癌症组合的估计值进行量化，不包括非黑色素瘤皮肤癌和 33 种特定癌症类型。使用死亡率与发病率比估计病死率。在世界、区域、人类发展指数 （HDI） 和收入水平上计算总体和性别特异性估计。我们使用联合国 2019 年世界人口展望修订版，将 GLOBOCAN 2022 比率应用于 2050 年的性别特定人口预测，从而估计了未来的癌症负担。 发现 2022 年，青少年和年轻人估计有 1 300 196 |
原文链接：xmolJournal
分类：#xmolJournal #Week462024
文献分享 | Nature Food：运用单细胞分离技术的方法检测土壤原生解磷菌原位活性
评论：No description available. |
原文链接：王永成Lab
分类：#王永成Lab #Week462024
评论：No description available. |
原文链接：王永成Lab
分类：#王永成Lab #Week462024
最新7+非肿瘤生信，结合衰老基因集+WGCNA+机器学习+耐药+PCR验证，经典思路值得收藏！
评论：No description available. |
原文链接：东晓生物
分类：#东晓生物 #Week462024
评论：No description available. |
原文链接：东晓生物
分类：#东晓生物 #Week462024
抗血管生成药联合 PD1 抑制剂治疗软组织肉瘤的预测和动态特征：与 IMMUNOSARC 试验相关的相关研究。
评论：目的 IMMUNOSARC 试验将抗血管生成药物 （舒尼替尼） 与 PD1 抑制剂 （纳武利尤单抗） 联合治疗晚期肉瘤。在这里，我们介绍了参加该试验的软组织肉瘤队列的第一批相关研究。实验设计 在基线和第 13 周收集福尔马林固定石蜡包埋和外周血样本。福尔马林固定石蜡包埋的样品用于转录组学和多重免疫荧光，而外周血样品用于多重免疫测定。进行流式细胞术和 Luminex 分析以验证肿瘤分离细胞和来自患者的外周血单核细胞的翻译结果。结果 通过多重免疫表型分析测量的瘤内 CD8 + T 细胞密度在治疗后显著增加。这种增强伴随着 CD86 、 CHI3L1 、 CXCL10 、 CXCL9 、 LAG3 和 VCAM1 基因表达的动态显着增加以及 NR4A1 表达水平的降低。在外周血中，第 13 周时治疗显著调节 12 种蛋白。整合 7 个基因和 12 个可溶性因子的动态表达的评分将具有不同无进展生存期 |
原文链接：xmolJournal
分类：#xmolJournal #Week462024
评论：目的 IMMUNOSARC 试验将抗血管生成药物 （舒尼替尼） 与 PD1 抑制剂 （纳武利尤单抗） 联合治疗晚期肉瘤。在这里，我们介绍了参加该试验的软组织肉瘤队列的第一批相关研究。实验设计 在基线和第 13 周收集福尔马林固定石蜡包埋和外周血样本。福尔马林固定石蜡包埋的样品用于转录组学和多重免疫荧光，而外周血样品用于多重免疫测定。进行流式细胞术和 Luminex 分析以验证肿瘤分离细胞和来自患者的外周血单核细胞的翻译结果。结果 通过多重免疫表型分析测量的瘤内 CD8 + T 细胞密度在治疗后显著增加。这种增强伴随着 CD86 、 CHI3L1 、 CXCL10 、 CXCL9 、 LAG3 和 VCAM1 基因表达的动态显着增加以及 NR4A1 表达水平的降低。在外周血中，第 13 周时治疗显著调节 12 种蛋白。整合 7 个基因和 12 个可溶性因子的动态表达的评分将具有不同无进展生存期 |
原文链接：xmolJournal
分类：#xmolJournal #Week462024
肿瘤细胞外基质刚度的高机械调节是 HER2 阴性乳腺癌抗纤维化治疗的预测生物标志物。
评论：目的 肿瘤进展与纤维化引起的细胞外基质硬化有关。癌细胞可以通过坚硬的细胞外基质进行机械调节，表现出 1,004 个基因特征 机械调节 （MeCo） 评分。尼达尼布在特发性肺纤维化中显示出抗纤维化活性。本研究探讨了尼达尼布对乳腺癌结果的抗纤维化作用。实验设计 我们提出了早期 HER2 阴性乳腺癌新辅助随机 II 期试验的长期随访和分析。患者 （N = 130） 接受了基线活检，并单独接受了 12 个紫杉醇疗程 （对照组） 或与尼达尼布联合治疗 （实验组）。通过 RNA 测序确定肿瘤 MeCo 评分。主要目的是根据 MeCo 评分评估尼达尼布对无事件生存率的影响。结果 检索 111 例患者的随访资料;对 75 个基线和 24 个磨合期后样本进行了测序。中位随访 9.67 年后，各组之间的中位无事件生存期无统计学差异 （P = 0.37）。然而，在对照组中，高 MeCo 患者与低 MeCo 患者的复发风险在统计学上更高：HR |
原文链接：xmolJournal
分类：#xmolJournal #Week462024
评论：目的 肿瘤进展与纤维化引起的细胞外基质硬化有关。癌细胞可以通过坚硬的细胞外基质进行机械调节，表现出 1,004 个基因特征 机械调节 （MeCo） 评分。尼达尼布在特发性肺纤维化中显示出抗纤维化活性。本研究探讨了尼达尼布对乳腺癌结果的抗纤维化作用。实验设计 我们提出了早期 HER2 阴性乳腺癌新辅助随机 II 期试验的长期随访和分析。患者 （N = 130） 接受了基线活检，并单独接受了 12 个紫杉醇疗程 （对照组） 或与尼达尼布联合治疗 （实验组）。通过 RNA 测序确定肿瘤 MeCo 评分。主要目的是根据 MeCo 评分评估尼达尼布对无事件生存率的影响。结果 检索 111 例患者的随访资料;对 75 个基线和 24 个磨合期后样本进行了测序。中位随访 9.67 年后，各组之间的中位无事件生存期无统计学差异 （P = 0.37）。然而，在对照组中，高 MeCo 患者与低 MeCo 患者的复发风险在统计学上更高：HR |
原文链接：xmolJournal
分类：#xmolJournal #Week462024
GDF-15 可预测上皮样血管内皮瘤的侵袭性，并通过 ATF4/ATF5 抑制被西罗莫司下调。
评论：目的上皮样血管内皮瘤 （EHE） 是一种极其罕见的肉瘤，由于常规化疗在晚期病例中的疗效有限，因此带来了治疗挑战，需要探索新的治疗途径并识别新的侵袭性生物标志物。本研究旨在 （i） 利用 EHE 及其相关细胞系的患者来源的异种移植模型来评估西罗莫司的疗效，以及 （ii） 分析两个不同的患者队列以查明 EHE 侵袭性的循环生物标志物。实验设计 从晚期 EHE 患者中建立了患者来源的异种移植模型和相应的细胞系，证明在组织形态学、WWTR1：：CAMTA1 融合存在以及基因组和转录组学谱方面与原始肿瘤一致。采用两个独立的患者系列研究生长/分化因子 15 （GDF-15） 血清水平与 EHE 侵袭性之间的关联。结果 对 EHE 细胞培养基和携带 EHE 的小鼠血液进行 ELISA 分析，发现 EHE 细胞释放 GDF-15。与阿霉素相比，西罗莫司表现出显着更高的抗肿瘤活性，同时降低体内和体外 GDF-15 |
原文链接：xmolJournal
分类：#xmolJournal #Week462024
评论：目的上皮样血管内皮瘤 （EHE） 是一种极其罕见的肉瘤，由于常规化疗在晚期病例中的疗效有限，因此带来了治疗挑战，需要探索新的治疗途径并识别新的侵袭性生物标志物。本研究旨在 （i） 利用 EHE 及其相关细胞系的患者来源的异种移植模型来评估西罗莫司的疗效，以及 （ii） 分析两个不同的患者队列以查明 EHE 侵袭性的循环生物标志物。实验设计 从晚期 EHE 患者中建立了患者来源的异种移植模型和相应的细胞系，证明在组织形态学、WWTR1：：CAMTA1 融合存在以及基因组和转录组学谱方面与原始肿瘤一致。采用两个独立的患者系列研究生长/分化因子 15 （GDF-15） 血清水平与 EHE 侵袭性之间的关联。结果 对 EHE 细胞培养基和携带 EHE 的小鼠血液进行 ELISA 分析，发现 EHE 细胞释放 GDF-15。与阿霉素相比，西罗莫司表现出显着更高的抗肿瘤活性，同时降低体内和体外 GDF-15 |
原文链接：xmolJournal
分类：#xmolJournal #Week462024
流程更新----10XHD的tiff图片结合cellpose进行细胞分割分析获取单细胞级别的空间表达矩阵
评论：No description available. |
原文链接：单细胞空间交响乐
分类：#单细胞空间交响乐 #Week462024
评论：No description available. |
原文链接：单细胞空间交响乐
分类：#单细胞空间交响乐 #Week462024
11.7分纯生信，整合多个单细胞及空转数据，揭示上皮和免疫细胞相互作用。作者共享了所有数据和代码（含获取方式）
评论：No description available. |
原文链接：生信小课堂
分类：#生信小课堂 #Week462024
评论：No description available. |
原文链接：生信小课堂
分类：#生信小课堂 #Week462024
6.3分基因集生信+实验验证。分析不难，实验也不多。通过公众号的文章也能看出哪些杂志对生信较友好！
评论：No description available. |
原文链接：生信小课堂
分类：#生信小课堂 #Week462024
评论：No description available. |
原文链接：生信小课堂
分类：#生信小课堂 #Week462024
在“杰青”手里，“转录组”都能玩到Cell顶刊！北京大学杜鹏团队力作，单细胞+表观，“测序”不等于没技术！
评论：No description available. |
原文链接：R语言学徒
分类：#R语言学徒 #Week462024
评论：No description available. |
原文链接：R语言学徒
分类：#R语言学徒 #Week462024
