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单细胞RNA测序：从RNA富集到cDNA合成的关键步骤
评论：文章概述文章标题：《Single-cell RNA sequencing technologies and |
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分类：#生信漫漫学 #Week242025
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沙特阿拉伯的全面癌症控制政策
评论：癌症正在成为沙特阿拉伯发病率和死亡率的主要原因，预计未来 20 年的发病率将翻一番。该国的医疗保健系统在过去四十年中经历了重大改革，从而更好地控制了传染病和非传染性疾病，从而延长了预期寿命。卫生部门转型计划是沙特 2030 年愿景的一部分，旨在加强对包括癌症在内的非传染性疾病的预防和控制，改善获得护理的机会，提供高质量的护理服务，提高患者的生活质量，并增加对研究和创新的支持。本系列论文强调了国家癌症控制计划取得的重大进展，确定了仍然存在的挑战和未来的机遇。我们设想本文将为下一个国家癌症控制计划的制定提供信息，该计划是可持续的、循证的、综合的、以患者为中心和以价值为导向的社会。 |
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评论：癌症正在成为沙特阿拉伯发病率和死亡率的主要原因，预计未来 20 年的发病率将翻一番。该国的医疗保健系统在过去四十年中经历了重大改革，从而更好地控制了传染病和非传染性疾病，从而延长了预期寿命。卫生部门转型计划是沙特 2030 年愿景的一部分，旨在加强对包括癌症在内的非传染性疾病的预防和控制，改善获得护理的机会，提供高质量的护理服务，提高患者的生活质量，并增加对研究和创新的支持。本系列论文强调了国家癌症控制计划取得的重大进展，确定了仍然存在的挑战和未来的机遇。我们设想本文将为下一个国家癌症控制计划的制定提供信息，该计划是可持续的、循证的、综合的、以患者为中心和以价值为导向的社会。 |
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改变约旦的癌症护理：由当地专家指导的以患者为中心的 10 年综合战略
评论：在本系列论文中，我们提出了约旦全面的 10 年癌症控制战略，正如一组约旦癌症护理和医学教育医学专家所概述的那样。该战略旨在创建一个强大的、以患者为中心、有弹性的医疗保健系统，其中优先考虑全面的全民癌症护理。我们评估了约旦癌症护理的现状、差距和挑战，并推荐了解决这些问题的纠正措施。拟议的框架讨论了约旦的癌症护理，包括公众意识和教育、预防、筛查、公平获得优质护理、护理后监测、幸存者和姑息治疗。除了劳动力培训、研究和支持服务外，该框架还强调需要采用循证实践、创新干预措施以及遵守与约旦相关的肿瘤学原则，包括标准化肿瘤学实践。该策略要求创建一个基于共识的框架来评估和监测实施，以具有成本效益和适用的方式确保系统的有效性和连续性，并使用常识肿瘤学方法。 |
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评论：在本系列论文中，我们提出了约旦全面的 10 年癌症控制战略，正如一组约旦癌症护理和医学教育医学专家所概述的那样。该战略旨在创建一个强大的、以患者为中心、有弹性的医疗保健系统，其中优先考虑全面的全民癌症护理。我们评估了约旦癌症护理的现状、差距和挑战，并推荐了解决这些问题的纠正措施。拟议的框架讨论了约旦的癌症护理，包括公众意识和教育、预防、筛查、公平获得优质护理、护理后监测、幸存者和姑息治疗。除了劳动力培训、研究和支持服务外，该框架还强调需要采用循证实践、创新干预措施以及遵守与约旦相关的肿瘤学原则，包括标准化肿瘤学实践。该策略要求创建一个基于共识的框架来评估和监测实施，以具有成本效益和适用的方式确保系统的有效性和连续性，并使用常识肿瘤学方法。 |
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在中东地区弥合边界，提高癌症控制韧性：沙特阿拉伯、卡塔尔和约旦的战略联盟
评论：癌症是中东地区导致死亡和发病的主要原因。沙特阿拉伯、卡塔尔和约旦拥有超过 4500 万人口，在过去三十年中，这三个国家的癌症发病率都呈上升趋势。在本系列论文中，我们分析了《 柳叶刀肿瘤学 》上三篇出版物中关于当前癌症负担、护理进展和仍然存在挑战的证据。我们还强调了三个国家在癌症控制议程中未来合作的共同机会。这三个国家的癌症护理和研究也取得了显着进展。然而，在维持对癌症护理的财政支持和解决已确定风险因素的高患病率以及由于人口变化而导致的预计发病率上升方面，挑战仍然存在。我们的分析表明，由于各国之间的相似性和共同目标，这种合作可以利用许多机会来改善癌症护理并降低癌症发病率。这些措施包括在协调癌症登记、跨境临床试验以及临床指南、预防措施和意识方面的区域领导合作。 |
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评论：癌症是中东地区导致死亡和发病的主要原因。沙特阿拉伯、卡塔尔和约旦拥有超过 4500 万人口，在过去三十年中，这三个国家的癌症发病率都呈上升趋势。在本系列论文中，我们分析了《 柳叶刀肿瘤学 》上三篇出版物中关于当前癌症负担、护理进展和仍然存在挑战的证据。我们还强调了三个国家在癌症控制议程中未来合作的共同机会。这三个国家的癌症护理和研究也取得了显着进展。然而，在维持对癌症护理的财政支持和解决已确定风险因素的高患病率以及由于人口变化而导致的预计发病率上升方面，挑战仍然存在。我们的分析表明，由于各国之间的相似性和共同目标，这种合作可以利用许多机会来改善癌症护理并降低癌症发病率。这些措施包括在协调癌症登记、跨境临床试验以及临床指南、预防措施和意识方面的区域领导合作。 |
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阿拉伯联合酋长国的癌症控制
评论：阿拉伯联合酋长国 （UAE） 正面临日益严重的癌症负担。尽管阿联酋继续在医疗保健方面进行大量投资，但癌症病例的增加给该国带来了相当大的健康、经济和社会压力，并且受到晚期治疗的复杂性、劳动力生产力的下降以及国民经济产出的更广泛影响的推动。阿联酋独特的人口结构，加上其医疗保健结构，需要从筛查到治疗的定制癌症控制方法。本系列论文评估了阿联酋癌症控制的现状，确定了当前系统中的障碍和差距，并提出了可行的改进建议。迫切需要一个全面的国家癌症控制计划，该计划由可靠的数据、国际伙伴关系和战略政策改革提供支持。主要举措包括扩大早期检测和筛查工作，改善进入多学科癌症中心的机会，以及采用先进的诊断技术。其他优先事项包括加强肿瘤学劳动力、促进公私合作伙伴关系、提高护理质量以及利用数字健康创新。公共卫生教育活动和公平的服务分配对于改善常见恶性肿瘤（尤其是乳腺癌、结直肠癌和肺癌）的预后也至关重要。在阿联酋 2031 |
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评论：阿拉伯联合酋长国 （UAE） 正面临日益严重的癌症负担。尽管阿联酋继续在医疗保健方面进行大量投资，但癌症病例的增加给该国带来了相当大的健康、经济和社会压力，并且受到晚期治疗的复杂性、劳动力生产力的下降以及国民经济产出的更广泛影响的推动。阿联酋独特的人口结构，加上其医疗保健结构，需要从筛查到治疗的定制癌症控制方法。本系列论文评估了阿联酋癌症控制的现状，确定了当前系统中的障碍和差距，并提出了可行的改进建议。迫切需要一个全面的国家癌症控制计划，该计划由可靠的数据、国际伙伴关系和战略政策改革提供支持。主要举措包括扩大早期检测和筛查工作，改善进入多学科癌症中心的机会，以及采用先进的诊断技术。其他优先事项包括加强肿瘤学劳动力、促进公私合作伙伴关系、提高护理质量以及利用数字健康创新。公共卫生教育活动和公平的服务分配对于改善常见恶性肿瘤（尤其是乳腺癌、结直肠癌和肺癌）的预后也至关重要。在阿联酋 2031 |
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卡塔尔国家癌症护理和研究：全球卓越卫生的开创性战略
评论：卡塔尔的癌症护理战略由国家癌症战略（2011 年）和随后的 2017-22 年框架制定，从而产生了 2023-2026 年卡塔尔癌症计划。这些举措强调预防、早期发现和循证管理，以减少癌症对患者和医疗保健系统的影响。对先进医疗基础设施、尖端技术和专业人员的投资大大加强了癌症护理。然而，挑战仍然存在，包括后期诊断和公众意识差距，这凸显了加强教育和全球合作的必要性。精准医疗、公共卫生计划和研究驱动型政策使卡塔尔成为肿瘤学领域的区域领导者。通过利用其强大的医疗保健和研究生态系统，卡塔尔旨在推进癌症预防、诊断和治疗。与世卫组织东地中海区域的目标保持一致，该国努力建立卓越的肿瘤服务模式。 |
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评论：卡塔尔的癌症护理战略由国家癌症战略（2011 年）和随后的 2017-22 年框架制定，从而产生了 2023-2026 年卡塔尔癌症计划。这些举措强调预防、早期发现和循证管理，以减少癌症对患者和医疗保健系统的影响。对先进医疗基础设施、尖端技术和专业人员的投资大大加强了癌症护理。然而，挑战仍然存在，包括后期诊断和公众意识差距，这凸显了加强教育和全球合作的必要性。精准医疗、公共卫生计划和研究驱动型政策使卡塔尔成为肿瘤学领域的区域领导者。通过利用其强大的医疗保健和研究生态系统，卡塔尔旨在推进癌症预防、诊断和治疗。与世卫组织东地中海区域的目标保持一致，该国努力建立卓越的肿瘤服务模式。 |
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在癌症实验模型中通过定制的化学诱变诱导错配修复缺陷基因型
评论：错配修复缺陷 （MMRd） 肿瘤含有数千个富含插入-缺失 （插入缺失） 的体细胞突变，因此对免疫治疗具有高度敏感性。我们试图使用诱变剂在免疫抗性细胞中复制这种表型，以设计 MMRd 基因型。替莫唑胺 （TMZ） 和顺铂的组合导致 Msh2 表观遗传缺失导致小鼠细胞系中富含插入缺失的高突变载量的快速积累。预处理的细胞对 PD-1 阻断敏感。用 TMZ 、 顺铂和携带抗 PD-1 的免疫耐药肿瘤细胞进行全身治疗导致存活率增加、瘤内 T 细胞浸润和 Msh2 表达下调，而不影响健康组织。在一项对 18 名难治性错配修复熟练的结直肠癌患者的临床试验中，未见反应，但 MMRd 特征出现在游离 DNA 中。这些发现表明，通过化学诱变概括 MMRd 基因型可以产生免疫原性表型。 |
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评论：错配修复缺陷 （MMRd） 肿瘤含有数千个富含插入-缺失 （插入缺失） 的体细胞突变，因此对免疫治疗具有高度敏感性。我们试图使用诱变剂在免疫抗性细胞中复制这种表型，以设计 MMRd 基因型。替莫唑胺 （TMZ） 和顺铂的组合导致 Msh2 表观遗传缺失导致小鼠细胞系中富含插入缺失的高突变载量的快速积累。预处理的细胞对 PD-1 阻断敏感。用 TMZ 、 顺铂和携带抗 PD-1 的免疫耐药肿瘤细胞进行全身治疗导致存活率增加、瘤内 T 细胞浸润和 Msh2 表达下调，而不影响健康组织。在一项对 18 名难治性错配修复熟练的结直肠癌患者的临床试验中，未见反应，但 MMRd 特征出现在游离 DNA 中。这些发现表明，通过化学诱变概括 MMRd 基因型可以产生免疫原性表型。 |
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统一的泛癌种蛋白质组图谱
评论：在本期《癌细胞》中，Knol 等人介绍了泛癌蛋白质组图谱 （TPCPA），这是一种使用单次数据非依赖性采集质谱法 （DIA-MS） 开发的蛋白质组学资源。TPCPA 以统一的方式提供 22 种癌症类型的 999 种肿瘤的蛋白质组级定量，用于发现肿瘤生物学、生物标志物和治疗靶点。 |
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评论：在本期《癌细胞》中，Knol 等人介绍了泛癌蛋白质组图谱 （TPCPA），这是一种使用单次数据非依赖性采集质谱法 （DIA-MS） 开发的蛋白质组学资源。TPCPA 以统一的方式提供 22 种癌症类型的 999 种肿瘤的蛋白质组级定量，用于发现肿瘤生物学、生物标志物和治疗靶点。 |
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顺铂和替莫唑胺联合治疗在实验性癌症模型中触发超突变性和免疫监视
评论：错配修复 （MMR） 失活诱导的超突变导致结直肠癌 （CRC） 和其他几种恶性肿瘤的免疫监视。我们研究了合理设计的化疗组合对免疫难治性 CRC 和乳腺癌小鼠模型中超突变和免疫原性产生的影响。顺铂 （CDDP） 和替莫唑胺 （TMZ） 联合治疗诱导 MMR 的适应性下调，导致化疗依赖性高突变性和预测新抗原的增加。这种组合特异性地改变了肿瘤的免疫适应性，最终导致 CD8 + T 细胞介导的免疫监视、化疗诱导的新抗原的免疫编辑和持久的免疫记忆。CDDP 和 TMZ 治疗还可以重塑先天免疫微环境，并与小鼠的抗 PD-1 治疗联合使用时诱导持久的反应和完全排斥反应。使用临床批准的 5-氟尿嘧啶、奥沙利铂和伊立替康 （FOLFOXIRI） 的组合未观察到相同的效果。治疗诱导的超突变可以增强抗肿瘤免疫反应，为癌症治疗提供额外的途径。 |
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评论：错配修复 （MMR） 失活诱导的超突变导致结直肠癌 （CRC） 和其他几种恶性肿瘤的免疫监视。我们研究了合理设计的化疗组合对免疫难治性 CRC 和乳腺癌小鼠模型中超突变和免疫原性产生的影响。顺铂 （CDDP） 和替莫唑胺 （TMZ） 联合治疗诱导 MMR 的适应性下调，导致化疗依赖性高突变性和预测新抗原的增加。这种组合特异性地改变了肿瘤的免疫适应性，最终导致 CD8 + T 细胞介导的免疫监视、化疗诱导的新抗原的免疫编辑和持久的免疫记忆。CDDP 和 TMZ 治疗还可以重塑先天免疫微环境，并与小鼠的抗 PD-1 治疗联合使用时诱导持久的反应和完全排斥反应。使用临床批准的 5-氟尿嘧啶、奥沙利铂和伊立替康 （FOLFOXIRI） 的组合未观察到相同的效果。治疗诱导的超突变可以增强抗肿瘤免疫反应，为癌症治疗提供额外的途径。 |
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CSF1R+ 髓系单核细胞驱动侵袭性 B 细胞淋巴瘤中的 CAR-T 细胞耐药性
评论：尽管有所改善，但大约 60% 的复发或难治性 （r/r） 侵袭性 B 细胞淋巴瘤 （B-NHL） 患者并未从 CAR-T 细胞疗法中获得持久获益。为了阐明与 CAR-T 治疗耐药相关的因素，我们对 CAR-T 前后细胞标本进行了高维分析。在反应不持久的患者中，我们确定了预后相关的淋巴瘤相关髓单核细胞 （LAMM） 基因特征。深入分析显示，在人和小鼠 B-NHL 中都有独特的 CSF1R + CD14 + CD68 + LAMM 细胞群，可抑制 CAR-T 细胞功能并与不良结果相关。细胞间推断分析发现，LAMM 细胞通过 PGE 2 -EP2/EP4 轴通过 LAMM-T 细胞直接相互作用损害 CAR-T 细胞功能。在本土淋巴瘤小鼠模型中，抗 CD19 CAR-T 细胞疗法与 CSF1R 阻断联合表现出协同效应并提高生存率。这些发现为抗 CD19 CAR-T 细胞与 CSF1R 抑制剂联合治疗 |
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评论：尽管有所改善，但大约 60% 的复发或难治性 （r/r） 侵袭性 B 细胞淋巴瘤 （B-NHL） 患者并未从 CAR-T 细胞疗法中获得持久获益。为了阐明与 CAR-T 治疗耐药相关的因素，我们对 CAR-T 前后细胞标本进行了高维分析。在反应不持久的患者中，我们确定了预后相关的淋巴瘤相关髓单核细胞 （LAMM） 基因特征。深入分析显示，在人和小鼠 B-NHL 中都有独特的 CSF1R + CD14 + CD68 + LAMM 细胞群，可抑制 CAR-T 细胞功能并与不良结果相关。细胞间推断分析发现，LAMM 细胞通过 PGE 2 -EP2/EP4 轴通过 LAMM-T 细胞直接相互作用损害 CAR-T 细胞功能。在本土淋巴瘤小鼠模型中，抗 CD19 CAR-T 细胞疗法与 CSF1R 阻断联合表现出协同效应并提高生存率。这些发现为抗 CD19 CAR-T 细胞与 CSF1R 抑制剂联合治疗 |
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通过靶向 IL-15R 信号传导增强自然杀伤细胞的抗肿瘤免疫力
评论：白细胞介素-15 受体 （IL-15R） 激动剂在临床前模型中诱导抗肿瘤免疫。然而，剂量限制性毒性阻碍了他们的临床开发。我们进行了全基因组 CRISPR 筛选，以揭示自然杀伤 （NK） 细胞中完整的 IL-15R 信号传导机制，发现泛素依赖性 IL-15R 降解是抑制 IL-15R 信号传导的主要机制。关键命中包括 NEDD8 E2 偶联酶 UBE2F、泛素 E3 连接酶 ARIH2 和 Cullin-5 环 E3 连接酶 （CRL5） 成员。我们发现 UBE2F 是 CUL5 的 neddylation 和激活所必需的，而 ARIH2 有助于 CRL5 介导的 IL-15RB 降解。ARIH2 或 UBE2F 消融增加了 IL-15RB 表面表达并增强了信号传导，导致促炎细胞因子的产生并增强了自然和 CAR 介导的细胞毒性。在缺乏 Arih2、Rnf7 或 Ube2f 的小鼠中，我们观察到 |
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评论：白细胞介素-15 受体 （IL-15R） 激动剂在临床前模型中诱导抗肿瘤免疫。然而，剂量限制性毒性阻碍了他们的临床开发。我们进行了全基因组 CRISPR 筛选，以揭示自然杀伤 （NK） 细胞中完整的 IL-15R 信号传导机制，发现泛素依赖性 IL-15R 降解是抑制 IL-15R 信号传导的主要机制。关键命中包括 NEDD8 E2 偶联酶 UBE2F、泛素 E3 连接酶 ARIH2 和 Cullin-5 环 E3 连接酶 （CRL5） 成员。我们发现 UBE2F 是 CUL5 的 neddylation 和激活所必需的，而 ARIH2 有助于 CRL5 介导的 IL-15RB 降解。ARIH2 或 UBE2F 消融增加了 IL-15RB 表面表达并增强了信号传导，导致促炎细胞因子的产生并增强了自然和 CAR 介导的细胞毒性。在缺乏 Arih2、Rnf7 或 Ube2f 的小鼠中，我们观察到 |
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药物诱导的错配修复缺陷：前景喜忧参半
评论：大多数转移性结直肠癌 （CRC） 是免疫原性低的错配修复熟练 （pMMR）。在本期《癌细胞》中，Vitiello 等人和 Rousseau 等人揭示了替莫唑胺-顺铂联合疗法在临床前 pMMR CRC 模型中诱导错配修复缺陷样表型并重塑肿瘤微环境，但临床试验要求进一步优化。 |
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评论：大多数转移性结直肠癌 （CRC） 是免疫原性低的错配修复熟练 （pMMR）。在本期《癌细胞》中，Vitiello 等人和 Rousseau 等人揭示了替莫唑胺-顺铂联合疗法在临床前 pMMR CRC 模型中诱导错配修复缺陷样表型并重塑肿瘤微环境，但临床试验要求进一步优化。 |
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癌症衰老
评论：细胞衰老是由各种内在和外源性应激源诱导的稳定细胞周期停滞状态，作为防止受损细胞增殖的保护机制。虽然这个过程对于组织稳态和肿瘤抑制至关重要，但衰老细胞 （SnC） 随着时间的推移而逐渐积累与年龄相关的病理有关，包括免疫功能障碍和癌症。在肿瘤学中，衰老起着自相矛盾的作用：它可以通过阻止潜在恶性细胞的生长来抑制肿瘤发展，但它也可能通过衰老相关分泌表型 （SASP） 促进肿瘤进展。本综述探讨了癌症衰老的定义特征、它与肿瘤细胞、基质和免疫系统的复杂相互作用，以及其上下文依赖性结果。我们还讨论了当前和新兴的靶向 SnC 的治疗策略（通过诱导或消除它们），以及用于癌症中 SnC 检测和表征的 AI 驱动方法。 |
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评论：细胞衰老是由各种内在和外源性应激源诱导的稳定细胞周期停滞状态，作为防止受损细胞增殖的保护机制。虽然这个过程对于组织稳态和肿瘤抑制至关重要，但衰老细胞 （SnC） 随着时间的推移而逐渐积累与年龄相关的病理有关，包括免疫功能障碍和癌症。在肿瘤学中，衰老起着自相矛盾的作用：它可以通过阻止潜在恶性细胞的生长来抑制肿瘤发展，但它也可能通过衰老相关分泌表型 （SASP） 促进肿瘤进展。本综述探讨了癌症衰老的定义特征、它与肿瘤细胞、基质和免疫系统的复杂相互作用，以及其上下文依赖性结果。我们还讨论了当前和新兴的靶向 SnC 的治疗策略（通过诱导或消除它们），以及用于癌症中 SnC 检测和表征的 AI 驱动方法。 |
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CellChat 数据集比较分析：识别细胞间通信的变化
评论：多个数据分析流程概述 加载需要的R包及数据 比较交互作用总数和交互作用强度 |
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分类：#生信漫漫学 #Week242025
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