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精准肿瘤学和转化癌症研究中的高度多重组织成像
精准肿瘤学根据患者的分子和健康数据定制治疗策略。尽管目前的诊断方法具有重要的临床价值，但苏木精和伊红形态学、免疫组化和基因面板测序的特征并不完整。相比之下，高度多重组织成像允许以单细胞分辨率对数十种标志物进行空间分析，从而能够分析复杂的肿瘤生态系统;因此，它有可能促进我们对癌症生物学的理解，并支持药物开发、生物标志物发现和患者分层。我们描述了可用的高度多重成像模式，讨论了它们在临床应用中的优缺点，以及将这些模式实施到临床实践中的潜在途径。意义： 本综述为如何将患者样本的高分辨率、多重组织成像整合到临床工作流程中提供了指导。它系统地比较了现有和新兴技术，并概述了精准肿瘤学领域的潜在应用，从而将不断发展的癌症研究格局与高度多重组织成像在常规临床实践中的实际实施可能性联系起来。 |
分类：#xmolJournal #Week442024
原文链接：xmolJournal
精准肿瘤学根据患者的分子和健康数据定制治疗策略。尽管目前的诊断方法具有重要的临床价值，但苏木精和伊红形态学、免疫组化和基因面板测序的特征并不完整。相比之下，高度多重组织成像允许以单细胞分辨率对数十种标志物进行空间分析，从而能够分析复杂的肿瘤生态系统;因此，它有可能促进我们对癌症生物学的理解，并支持药物开发、生物标志物发现和患者分层。我们描述了可用的高度多重成像模式，讨论了它们在临床应用中的优缺点，以及将这些模式实施到临床实践中的潜在途径。意义： 本综述为如何将患者样本的高分辨率、多重组织成像整合到临床工作流程中提供了指导。它系统地比较了现有和新兴技术，并概述了精准肿瘤学领域的潜在应用，从而将不断发展的癌症研究格局与高度多重组织成像在常规临床实践中的实际实施可能性联系起来。 |
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在 3D 基因组的背景下靶向癌症治疗的非编码顺式调节元件
摘要： 已经做出了重大努力来鉴定和验证癌蛋白和 ncRNAs 作为癌症治疗的治疗靶点;然而，新出现的观察结果表明，协调基因组 3D 组织从而协调转录景观的非编码顺式调节元件也是潜在的治疗靶点。在本评论中，我们设想进一步努力破译非编码顺式调节密码，并对肿瘤组织内癌性和非恶性细胞中的功能性非编码顺式调节元件和复发性 3D 基因组改变进行系统调查，这将为开发新的治疗策略铺平道路。 |
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摘要： 已经做出了重大努力来鉴定和验证癌蛋白和 ncRNAs 作为癌症治疗的治疗靶点;然而，新出现的观察结果表明，协调基因组 3D 组织从而协调转录景观的非编码顺式调节元件也是潜在的治疗靶点。在本评论中，我们设想进一步努力破译非编码顺式调节密码，并对肿瘤组织内癌性和非恶性细胞中的功能性非编码顺式调节元件和复发性 3D 基因组改变进行系统调查，这将为开发新的治疗策略铺平道路。 |
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联合诊断：在低剂量 CT 成像中加入基于血液的 ctDNA 筛查以早期发现肺癌
摘要： 对有吸烟史的个体进行年度低剂量 CT 筛查可识别早期可治愈的肺肿瘤，并将癌症死亡率降低 20%，但只有少数符合条件的患者接受了此类监测。Mazzone 及其同事将基于血液的 cfDNA 片段组学检测作为高灵敏度/低特异性的预筛查，以帮助对可能从更明确的低剂量 CT 成像中受益最多的个体进行分层。参见 Mazzone 等人的相关文章，第 2224 页 |
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摘要： 对有吸烟史的个体进行年度低剂量 CT 筛查可识别早期可治愈的肺肿瘤，并将癌症死亡率降低 20%，但只有少数符合条件的患者接受了此类监测。Mazzone 及其同事将基于血液的 cfDNA 片段组学检测作为高灵敏度/低特异性的预筛查，以帮助对可能从更明确的低剂量 CT 成像中受益最多的个体进行分层。参见 Mazzone 等人的相关文章，第 2224 页 |
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表面之下：染色体 DNA 突变之外的新抗原
摘要： 传统观点认为，绝大多数新抗原是由染色体DNA突变引起的;然而，最近的研究表明，转录后和翻译后事件也可以产生新抗原。本评论概述了非染色体新抗原的已知和潜在来源、新兴技术和临床试验，这些技术可能会推动该领域向前发展，以重新定义免疫学上的“热/冷”肿瘤并开发下一代免疫治疗方法。 |
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摘要： 传统观点认为，绝大多数新抗原是由染色体DNA突变引起的;然而，最近的研究表明，转录后和翻译后事件也可以产生新抗原。本评论概述了非染色体新抗原的已知和潜在来源、新兴技术和临床试验，这些技术可能会推动该领域向前发展，以重新定义免疫学上的“热/冷”肿瘤并开发下一代免疫治疗方法。 |
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对 RAS 抑制剂耐药的另一面
摘要： 在本期中，四篇文章强调了非遗传机制和细胞可塑性在介导胰腺导管腺癌和非小细胞肺癌对不同类别 RAS 抑制剂的耐药性中的关键作用。参见 Benitz 等人的相关文章，第 2162 页 参见 Dilly 等人的相关文章，第 2135 页 参见 Araujo 等人的相关文章，第 2183 页 参见 Singhal 等人的相关文章，第 2122 页 |
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摘要： 在本期中，四篇文章强调了非遗传机制和细胞可塑性在介导胰腺导管腺癌和非小细胞肺癌对不同类别 RAS 抑制剂的耐药性中的关键作用。参见 Benitz 等人的相关文章，第 2162 页 参见 Dilly 等人的相关文章，第 2135 页 参见 Araujo 等人的相关文章，第 2183 页 参见 Singhal 等人的相关文章，第 2122 页 |
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探索饮食、肥胖、免疫功能和癌症的相互作用
摘要： 本评论深入探讨了饮食、肥胖、免疫功能和癌症之间的复杂关系，强调了饮食干预作为癌症治疗中补充疗法的潜在作用。多项分析强调了个性化饮食策略在癌症管理中的重要性，并确定了在这个不断发展的领域进一步研究的机会。 |
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通过基于 AI 的传统医学和西医结合来推进癌症预防
摘要： 中医在个体化癌症预防方面积累了丰富的经验，是西医的补充。我们提出了一种基于人工智能的传统医学和西医整合，作为癌症预防的新范式，包括癌症风险筛查和预防性干预，这将为癌症预防提供新的解决方案，并为全球传统医学研究提供新的视角。 |
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摘要： 中医在个体化癌症预防方面积累了丰富的经验，是西医的补充。我们提出了一种基于人工智能的传统医学和西医整合，作为癌症预防的新范式，包括癌症风险筛查和预防性干预，这将为癌症预防提供新的解决方案，并为全球传统医学研究提供新的视角。 |
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通过动态肿瘤发生的全面作图进行早期癌症检测
摘要： 目前早期癌症检测和诊断的策略需要更新以实现更高的精度，因此需要创建肿瘤发生的综合进化图谱。这需要建立高质量的前瞻性队列，系统地收集样本以进行综合时空多组学分析，并有效地将实验室结果转化为临床应用。 |
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构建癌症标志物的器官范围宏观视图
摘要： 尽管在分子或原子分辨率下对癌症标志的了解越来越详细，但大多数研究都未能调查癌症与人体的全身相互作用。我们建议从器官范围的宏观角度研究癌症的特征，讨论临床前和临床研究中研究癌症跨器官调控的挑战以及克服这些挑战的潜在方向，并预见这种整体观点如何转化为更有效的疗法。 |
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摘要： 尽管在分子或原子分辨率下对癌症标志的了解越来越详细，但大多数研究都未能调查癌症与人体的全身相互作用。我们建议从器官范围的宏观角度研究癌症的特征，讨论临床前和临床研究中研究癌症跨器官调控的挑战以及克服这些挑战的潜在方向，并预见这种整体观点如何转化为更有效的疗法。 |
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个性化辅助 mRNA 癌症疫苗的免疫原性和疗效
摘要： 在本期中，Gainor 及其同事报告了个性化新抗原编码 mRNA 疫苗的免疫原性，这些疫苗在肿瘤切除的患者中引起可测量的多功能 CD8+ 和 CD4+ T 细胞反应。在 1 期临床试验 （NCT03313778） 的背景下，4 名术后单独接受疫苗治疗的 NSCLC 患者和 12 名接受个体化疫苗加帕博利珠单抗治疗的黑色素瘤患者，反应性证实为预测 MHC-I 和 MHC-II 表位的 20% 至 30%。参见 Gainor 等人的相关文章，第 2209 页 |
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摘要： 在本期中，Gainor 及其同事报告了个性化新抗原编码 mRNA 疫苗的免疫原性，这些疫苗在肿瘤切除的患者中引起可测量的多功能 CD8+ 和 CD4+ T 细胞反应。在 1 期临床试验 （NCT03313778） 的背景下，4 名术后单独接受疫苗治疗的 NSCLC 患者和 12 名接受个体化疫苗加帕博利珠单抗治疗的黑色素瘤患者，反应性证实为预测 MHC-I 和 MHC-II 表位的 20% 至 30%。参见 Gainor 等人的相关文章，第 2209 页 |
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药物 p53：障碍、标准和前景
摘要： 药理学靶向肿瘤抑制因子需要一种前所未有的策略来恢复蛋白质功能，而不是常规抑制蛋白质功能，因此 p53 是癌症中最常见的突变蛋白，因此仍然不可成药。在这项研究中，我们解决了该领域长期存在的误解和 p53 功能恢复策略科学逻辑中的空白，确定了突变体 p53 药物的四个障碍，并相应地提出了突变 p53 拯救化合物的有效性评估标准、临床转化规范和前景。 |
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摘要： 药理学靶向肿瘤抑制因子需要一种前所未有的策略来恢复蛋白质功能，而不是常规抑制蛋白质功能，因此 p53 是癌症中最常见的突变蛋白，因此仍然不可成药。在这项研究中，我们解决了该领域长期存在的误解和 p53 功能恢复策略科学逻辑中的空白，确定了突变体 p53 药物的四个障碍，并相应地提出了突变 p53 拯救化合物的有效性评估标准、临床转化规范和前景。 |
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通过多参数 MRI 评估脑肿瘤淋巴功能的组织病理学相关性研究。
目的 本研究旨在通过利用先进的 MRI 技术探讨肿瘤特征、淋巴功能和水通道蛋白 4 （AQP4） 表达水平之间的关系，阐明脑肿瘤对脑水肿和淋巴引流的影响。实验设计 在 2022 年 3 月至 2023 年 4 月的前瞻性队列中，胶质母细胞瘤、脑转移和侵袭性脑膜瘤患者与年龄和性别匹配的健康对照者一起接受了 3.0T MRI，包括沿血管周围间隙 （DTI-ALPS） 指数的弥散张量成像分析和用于定量脑标测的多参数 MRI。通过免疫荧光分析肿瘤和瘤周组织的 AQP4 表达水平。对 MRI 参数、淋巴功能 （DTI-ALPS 指数） 和 AQP4 表达水平之间的相关性进行统计学评估。结果 在 84 名患者 （平均年龄： 55 ± 12 岁;38 名男性） 和 59 名对照 （平均年龄： 54 ± 8 岁;23 名男性） 中，脑肿瘤患者的淋巴功能显著降低 （DTI-ALPS 指数： 2.315 vs |
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目的 本研究旨在通过利用先进的 MRI 技术探讨肿瘤特征、淋巴功能和水通道蛋白 4 （AQP4） 表达水平之间的关系，阐明脑肿瘤对脑水肿和淋巴引流的影响。实验设计 在 2022 年 3 月至 2023 年 4 月的前瞻性队列中，胶质母细胞瘤、脑转移和侵袭性脑膜瘤患者与年龄和性别匹配的健康对照者一起接受了 3.0T MRI，包括沿血管周围间隙 （DTI-ALPS） 指数的弥散张量成像分析和用于定量脑标测的多参数 MRI。通过免疫荧光分析肿瘤和瘤周组织的 AQP4 表达水平。对 MRI 参数、淋巴功能 （DTI-ALPS 指数） 和 AQP4 表达水平之间的相关性进行统计学评估。结果 在 84 名患者 （平均年龄： 55 ± 12 岁;38 名男性） 和 59 名对照 （平均年龄： 54 ± 8 岁;23 名男性） 中，脑肿瘤患者的淋巴功能显著降低 （DTI-ALPS 指数： 2.315 vs |
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胰腺癌经典和基础转录亚型的临床和基因组特征。
目的 胰腺癌的转录分析定义了两种主要的转录亚型：经典亚型和基础亚型。初步数据表明，基底肿瘤患者的生存期较短，并且不同转录亚型对 FOLFIRINOX 和吉西他滨加白蛋白结合型紫杉醇的治疗敏感性不同。实验设计 我们检查了 8,743 名在 Caris Life Sciences 进行的胰腺癌 RNA 测序患者。在 RNA 测序上使用纯度无关亚型算法鉴定经典亚型和基础亚型，并分析了两个队列：（i） 生物标志物队列包括具有完整分子分析数据的患者 （n = 7,250） 和 （ii） 结果队列包括具有可用生存结果的转移性疾病患者 （n = 5,335）。两个队列共有 3,842 名患者。采用 Kaplan-Meier 曲线和 Cox 比例风险回归评估患者生存率。结果 在生物标志物队列中，3,063 例肿瘤 （42.2%） 为强经典 （SC），2,015 例肿瘤 （27.8%） 为强基底 （SB）。SC |
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目的 胰腺癌的转录分析定义了两种主要的转录亚型：经典亚型和基础亚型。初步数据表明，基底肿瘤患者的生存期较短，并且不同转录亚型对 FOLFIRINOX 和吉西他滨加白蛋白结合型紫杉醇的治疗敏感性不同。实验设计 我们检查了 8,743 名在 Caris Life Sciences 进行的胰腺癌 RNA 测序患者。在 RNA 测序上使用纯度无关亚型算法鉴定经典亚型和基础亚型，并分析了两个队列：（i） 生物标志物队列包括具有完整分子分析数据的患者 （n = 7,250） 和 （ii） 结果队列包括具有可用生存结果的转移性疾病患者 （n = 5,335）。两个队列共有 3,842 名患者。采用 Kaplan-Meier 曲线和 Cox 比例风险回归评估患者生存率。结果 在生物标志物队列中，3,063 例肿瘤 （42.2%） 为强经典 （SC），2,015 例肿瘤 （27.8%） 为强基底 （SB）。SC |
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