泛癌种蛋白质组图谱，一种基于质谱的图谱，用于发现肿瘤生物学、生物标志物和治疗靶点
评论：迄今为止，大多数癌症蛋白质组学研究都集中在单一癌症类型上。我们报告了基于数据非依赖性采集质谱法的泛癌蛋白质组图谱 （TPCPA），以更好地了解癌症生物学并确定治疗靶点和生物标志物。TPCPA 包括来自代表 22 种癌症类型的 999 个原发性肿瘤的 9,670 种蛋白质。我们通过广泛的外部注释描述了泛癌和癌症类型富集的蛋白质，优先考虑候选药物靶点和生物标志物。与蛋白水解靶向嵌合体相关，我们鉴定了在特定肿瘤类型中高度表达的 E3-泛素连接酶，包括 HERC5 （食管癌） 和 RNF5 （肝癌）。共表达分析揭示了 13 个模块，包括作为潜在药物靶标的意外枢纽蛋白（例如 GFPT1、LRPPRC、PINK1、DOCK2 和 PTPN6）。对 195 例结直肠癌的分析确定了基于 RNA 的共有分子亚型 （CMS） 和两种具有预后价值的免疫亚型的蛋白质标志物。我们报告了一个癌症类型分类器，用于识别原发性未知的癌症。所有 |
原文链接：xmolJournal
分类：#xmolJournal #Week222025
评论：迄今为止，大多数癌症蛋白质组学研究都集中在单一癌症类型上。我们报告了基于数据非依赖性采集质谱法的泛癌蛋白质组图谱 （TPCPA），以更好地了解癌症生物学并确定治疗靶点和生物标志物。TPCPA 包括来自代表 22 种癌症类型的 999 个原发性肿瘤的 9,670 种蛋白质。我们通过广泛的外部注释描述了泛癌和癌症类型富集的蛋白质，优先考虑候选药物靶点和生物标志物。与蛋白水解靶向嵌合体相关，我们鉴定了在特定肿瘤类型中高度表达的 E3-泛素连接酶，包括 HERC5 （食管癌） 和 RNF5 （肝癌）。共表达分析揭示了 13 个模块，包括作为潜在药物靶标的意外枢纽蛋白（例如 GFPT1、LRPPRC、PINK1、DOCK2 和 PTPN6）。对 195 例结直肠癌的分析确定了基于 RNA 的共有分子亚型 （CMS） 和两种具有预后价值的免疫亚型的蛋白质标志物。我们报告了一个癌症类型分类器，用于识别原发性未知的癌症。所有 |
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