空间转录组学推进了犬类患者在癌症研究中的应用：对参加临床试验的携带骨肉瘤的宠物狗的分析
评论：目的。宠物狗会自发地发展出许多与人类相同的肿瘤类型，包括骨肉瘤。空间转录组学的最新进展提高了我们利用犬尸检中收集的福尔马林固定石蜡包埋组织的能力。这些技术允许将犬模型与小鼠模型一起研究，为人类癌症研究提供信息。在此，我们首次将 GeoMx 犬癌图谱应用于参加骨肉瘤临床试验的犬患者的结果相关样本。试验设计。使用 GeoMx 数字空间分析器对原发性骨肉瘤样本的组织微阵列 （TMA） 进行检测。样本按无病区间 （DFI） 分层。上三分位数和下三分位数内的患者分别被分配到高 （n = 8） 和低 DFI （n = 8） 组。分析包括差异表达基因的鉴定、通路富集和细胞反卷积。结果。在高 DFI 肿瘤中富集的基因包括 PTEN 和 CDKN1B。低 DFI 肿瘤富集 NCAM1。低 DFI 组中富集的通路包括 MYC 、 MTORC1 和氧化磷酸化。高 DFI 肿瘤富集了干扰素 α 反应和同种异体移植物排斥通路等。巨噬细胞和 |
原文链接：xmolJournal
分类：#xmolJournal #Week212025
评论：目的。宠物狗会自发地发展出许多与人类相同的肿瘤类型，包括骨肉瘤。空间转录组学的最新进展提高了我们利用犬尸检中收集的福尔马林固定石蜡包埋组织的能力。这些技术允许将犬模型与小鼠模型一起研究，为人类癌症研究提供信息。在此，我们首次将 GeoMx 犬癌图谱应用于参加骨肉瘤临床试验的犬患者的结果相关样本。试验设计。使用 GeoMx 数字空间分析器对原发性骨肉瘤样本的组织微阵列 （TMA） 进行检测。样本按无病区间 （DFI） 分层。上三分位数和下三分位数内的患者分别被分配到高 （n = 8） 和低 DFI （n = 8） 组。分析包括差异表达基因的鉴定、通路富集和细胞反卷积。结果。在高 DFI 肿瘤中富集的基因包括 PTEN 和 CDKN1B。低 DFI 肿瘤富集 NCAM1。低 DFI 组中富集的通路包括 MYC 、 MTORC1 和氧化磷酸化。高 DFI 肿瘤富集了干扰素 α 反应和同种异体移植物排斥通路等。巨噬细胞和 |
原文链接：xmolJournal
分类：#xmolJournal #Week212025
