细胞在患病组织中保持多样性
评论：新兴的空间分析技术彻底改变了我们对组织结构如何影响疾病进展的理解，但细胞多样性的贡献仍未得到充分探索。在这里，Ding 和同事介绍了多组学和生态空间分析 （MESA），这是一个受生态学启发的框架，它整合了空间和单细胞表达数据，以量化多个尺度上的组织多样性。MESA 既能识别不同的细胞邻域，又能计算各种多样性指标，同时确定多样性“热点”。应用于人扁桃体组织，MESA 揭示了以前未检测到的生发中心组织，而在小鼠狼疮模型的脾组织中，MESA 突出了随着疾病进展而增加的细胞多样性。重要的是，多样性热点与现有方法识别的常规区间不对应，呈现出空间组织的正交度量。在结直肠癌中，MESA 的多样性指标在预测患者生存率方面优于已建立的亚型，而在肝细胞癌中，与单一模式分析相比，多组学整合发现免疫细胞之间的配体-受体相互作用明显更多。这项工作将组织内的细胞多样性确立为疾病进展的关键相关性，并强调了多组学整合在空间生物学中的价值。 |
原文链接：xmolJournal
分类：#xmolJournal #Week202025
评论：新兴的空间分析技术彻底改变了我们对组织结构如何影响疾病进展的理解，但细胞多样性的贡献仍未得到充分探索。在这里，Ding 和同事介绍了多组学和生态空间分析 （MESA），这是一个受生态学启发的框架，它整合了空间和单细胞表达数据，以量化多个尺度上的组织多样性。MESA 既能识别不同的细胞邻域，又能计算各种多样性指标，同时确定多样性“热点”。应用于人扁桃体组织，MESA 揭示了以前未检测到的生发中心组织，而在小鼠狼疮模型的脾组织中，MESA 突出了随着疾病进展而增加的细胞多样性。重要的是，多样性热点与现有方法识别的常规区间不对应，呈现出空间组织的正交度量。在结直肠癌中，MESA 的多样性指标在预测患者生存率方面优于已建立的亚型，而在肝细胞癌中，与单一模式分析相比，多组学整合发现免疫细胞之间的配体-受体相互作用明显更多。这项工作将组织内的细胞多样性确立为疾病进展的关键相关性，并强调了多组学整合在空间生物学中的价值。 |
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