囊性胰腺癌前体的整合代谢组学和空间转录组学揭示了多胺代谢失调是进展的生物标志物
评论:目的:我们对公认的胰腺癌前体导管内状粘液肿瘤 (IPMN) 进行了代谢组学和空间细胞转录组学,以确定告知 IPMN 恶性肿瘤风险的肿瘤代谢物。实验设计: 对 125 例低度异型增生 (LG) 或高级别 (HG) 异型增生伴/不伴并发 PDAC (IPMN/PDAC) 患者的囊性液进行非靶向代谢组学分析。确定单个代谢物识别 HG 或 PDAC/IPMN 的预测性能,并与 CA19-9 性能进行比较。数据与切除的 IPMN 组织和小鼠 Kare 的代谢特征相交;GNAS IPMN 细胞系以及 IPMN 的空间和单细胞转录组学。结果: 共定量囊性液中 388 种代谢物,其中 69 种是病例 (HG IPMN + IPMN/PDAC) 和 LG IPMN 患者之间的差异 (p 值 <0.05)。亚精胺和精胺的生物合成和分解代谢被确定为最受干扰的代谢途径 (FDR 校正 p 值< 0.0001)。囊性液亚精胺、 |
原文链接:xmolJournal
分类:#xmolJournal #Week142025
评论:目的:我们对公认的胰腺癌前体导管内状粘液肿瘤 (IPMN) 进行了代谢组学和空间细胞转录组学,以确定告知 IPMN 恶性肿瘤风险的肿瘤代谢物。实验设计: 对 125 例低度异型增生 (LG) 或高级别 (HG) 异型增生伴/不伴并发 PDAC (IPMN/PDAC) 患者的囊性液进行非靶向代谢组学分析。确定单个代谢物识别 HG 或 PDAC/IPMN 的预测性能,并与 CA19-9 性能进行比较。数据与切除的 IPMN 组织和小鼠 Kare 的代谢特征相交;GNAS IPMN 细胞系以及 IPMN 的空间和单细胞转录组学。结果: 共定量囊性液中 388 种代谢物,其中 69 种是病例 (HG IPMN + IPMN/PDAC) 和 LG IPMN 患者之间的差异 (p 值 <0.05)。亚精胺和精胺的生物合成和分解代谢被确定为最受干扰的代谢途径 (FDR 校正 p 值< 0.0001)。囊性液亚精胺、 |
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