破译基于多种翻译后修饰、功能相关的调节模式和人肝细胞癌的治疗机会的分析
评论：翻译后修饰 （PTM） 在肝细胞癌 （HCC） 中起着关键作用。然而，PTM 修饰位点在 HCC 中蛋白质二级结构和调节模式的位置在很大程度上仍未表征。通过 4D 标记无蛋白质组学分析结合基于 PTM 的肽富集，系统分析了 18 例 HCC 患者肿瘤切片中的总蛋白质组和 9 个 PTM （磷酸化、乙酰化、巴豆酰化、泛素化、乳酸化、N-糖基化、琥珀酰化、丙二酰化和 β-羟基丁酰化）和配对的正常邻组织。我们在具有磷酸化位点的固有无序蛋白区域 （IDR） 的位置检测到强大的偏好，而其他位点偏倚位于折叠区域。整合分析显示，磷酸化和多个酰化修饰位点在含有 RRM1 结构域的蛋白质中富集，RNA 剪接是该蛋白质子集的关键特征，剪接因子 NCL 在多个残基处的磷酸化和酰化表明了这一点。我们证实 NCL-S67 、 K398 和 K646 协同调节 RNA 加工。总之，该蛋白质组分析代表了一项全面的研究，详细说明了基于 |
原文链接：xmolJournal
分类：#xmolJournal #Week522024
评论：翻译后修饰 （PTM） 在肝细胞癌 （HCC） 中起着关键作用。然而，PTM 修饰位点在 HCC 中蛋白质二级结构和调节模式的位置在很大程度上仍未表征。通过 4D 标记无蛋白质组学分析结合基于 PTM 的肽富集，系统分析了 18 例 HCC 患者肿瘤切片中的总蛋白质组和 9 个 PTM （磷酸化、乙酰化、巴豆酰化、泛素化、乳酸化、N-糖基化、琥珀酰化、丙二酰化和 β-羟基丁酰化）和配对的正常邻组织。我们在具有磷酸化位点的固有无序蛋白区域 （IDR） 的位置检测到强大的偏好，而其他位点偏倚位于折叠区域。整合分析显示，磷酸化和多个酰化修饰位点在含有 RRM1 结构域的蛋白质中富集，RNA 剪接是该蛋白质子集的关键特征，剪接因子 NCL 在多个残基处的磷酸化和酰化表明了这一点。我们证实 NCL-S67 、 K398 和 K646 协同调节 RNA 加工。总之，该蛋白质组分析代表了一项全面的研究，详细说明了基于 |
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