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08:01 · Nov 17, 2024 · Sun
python做单细胞有什么优势吗
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分类:#生信星球 #Week472024
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python做单细胞有什么优势吗
好像很多人都知道了,我今年夏天开始研究python了,还立下了flag月底要讲python课了,主要就是为了单细胞和机器学习。\x0a昨天发了cellpist这个自动注释工具,有了上面的留言↑\x0a我来简单解释一下:\x0a首先是内存,R语言的seurat做单细胞超级吃内存,细胞数量多了就很费计算资源,大的数据要有服务器才能搞。比如我的64G内存的电脑只能处理六七万细胞,十几万细胞就跑不了了。而python的scanpy计算效率就高一些,处理十几万的细胞是没有问题的。\x0a其次是多线程计算,R语言是…
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